南开大学亚太经合组织(APEC)研究中心是我国为落实“亚太经合组织领导人教育倡议”，由原国家教委、外交部、外经贸部协商，依据国家教委批示(教外际[1994]540号)于1995年3月成立。
中心的主要任务包括：研究APEC与APEC成员相关的经济问题，为我国参加每年一度的APEC领导人非正式会议和APEC部长级会议提供政策咨询；协调中国的APEC问题研究，并在研究中起到示范和组织作用，开展同APEC其他成员的研究中心合作研究；举办高层次的培训活动。
自1989年以来，APEC已经举行了十三届部长级会议和九次APEC领导人非正式会议，我国由外交部长和外经贸部长代表中国参加部长级会议，江泽民主席参加APEC领导人非正式会议。目前APEC共有21个成员，其中包括19个国家和2个地区，他们是美国、加拿大、墨西哥、智利、秘鲁、俄罗斯、日本、韩国、澳大利亚、新西兰、巴布亚新几内亚、泰国、新加坡、马来西亚、菲律宾、印度尼西亚、文莱、越南、中国，两个地区为中国台北、中国香港。
南开大学APEC研究中心在教育部的指导下，在南开大学各级领导的支持和帮助下，以新的模式开展各项工作。
南开大学跨国公司研究中心成立于1992年8月，2000年9月被教育部批准未普通高等学校人文社会科学国家重点研究基地，是我国最有影响的跨国公司研究基地之一。目前中心有专职研究人员12人，其中博士生导师10人，兼职研究人员14人。
中心作为全国性的跨国公司研究基地，以建立国际一流的研究中心为目标，比且跟踪跨国公司的发展动态，联系跨国公司对中国经济发展的作用以及相关的政策问题，进行深入的理论于政策研究，发表了一大批很有影响的研究成果。中心注重跨国公司对我国经济的影响及相关政策的研究，并向各级政府部分提交了多篇重要的咨询报告。中心十分重视高层次人才的培养，注重研究生的理论和发放训练，积极吸收研究生参与课题研究，为社会培养了一大批优秀人才。
中心作为我国跨国公司领域主要的学术交流基地，定期和不定期召开学术会议，并广泛邀请国外学者参加。
政治经济学研究中心是以南开大学经济研究所为基础重新组合的跨院系、跨学科的实体性开放式研究机构。经济学科是南开大学的支柱学科之一.南开大学经济研究所创立于1927年，是一所在国内外享有盛誉、历史悠久的高层次经济研究机构，是旧中国高等学校中最早培养经济学硕士学位研究生的研究机构.自1935-1949年共招收研究生十一届，总计六十多名。1949年后的两届毕业生被授予新中国第一批经济学硕士学位。该所对西方经济学理论的传播和研究，对旧中国社会经济的实证分析。特别是当时在充分调查研究的基础上编制的"南开物价指数"，在当时就为国内外社科界所瞩目，在国际上享有很高的声誉。新中国建立以后,我校在藤维藻、谷书堂、魏埙等教授的组织领导下，坚持以马克思主义为指导，对当代资本主义经济和社会主义经济进行了深入的研究,在政治经济学领域推出了一批有深度、有影响的论文和学术著作,如《中国原始资本积累》《价值规律及其在资本主义各个阶段上的作用》《什么是资本主义总危机》等等，对国内学术界基本经济理论的研究起了积极的推动作用。党的十一届三中全会以后，根据经济科学发展和现代化建设的需要，我校加强了政治经济学研究力量,重新调整了研究方向,使基础的经济理论的研究和学术队伍呈现出迅速发展的局面，取得了更突出的成绩.1999年底,我校根据教育部建设人文社会科学重点科研基地的要求，为建成国内一流和在国际上也有重要影响的政治经济学研究基地、学术交流基地、人才培养基地、咨询服务基地与体制改革示范基地，为高起点、高要求的建设该中心，再次对政治经济学的研究机构和力量进行了组合和配置，组建了政治经济学研究中心.一方面,根据我们的学科基础、学科发展和社会发展的需要，重新确定中心的重点研究方向主要是三个，即社会主义经济理论研究，现代资本主义经济研究，知识经济研究，相应的中心设立三个研究室。中心顾问为谷书堂、朱光华、魏埙、高峰教授。另一方面,深化科研体制改革,打破原有院、系、所的框架，重新配备了中心的科研力量，市中心学术队伍的知识结构、职称结构、学历结构和年龄结构有了明显改善，科研力量明显提高。
