吉林大学经济学院的历史可以追溯到1946年吉林大学前身哈尔滨大学社会科学院设置的经济系（1946年10月）、东北行政学院的经济学科（1949年8月）和东北人民大学的经济学科（1951年3月）。1985年11月，经国家教委批准成立吉林大学经济管理学院。2000年6月，吉林大学与吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院5所高校合并，组建新吉林大学。2001年5月，新吉林大学进行院系调整，在原吉林大学经济管理学院的基础上，整合其他高校的经济学科，组成经济学院。经过长期的建设和发展，吉林大学经济学院在学科建设、师资队伍建设、人才培养、科学研究等方面成就斐然。
经济学院现有经济学、国际经济与贸易、金融学（含保险）、财政学（含税务）4个本科专业，有政治经济学、世界经济、西方经济学、经济史、制度经济学、法经济学、国民经济学、产业经济学、金融学、国际贸易学、财政学、企业管理、会计学和卫生经济学14个硕士点，有政治经济学、世界经济、西方经济学、制度经济学、法经济学5个博士点，并设有理论经济学博士后科研流动站。1994年和2002年，政治经济学专业、世界经济专业分别被评为吉林省普通高等教育重点学科。1998年，教育部批准经济学院设立“国家经济学基础人才培养基地”。2000年，理论经济学被国务院学位委员会批准获得一级学科博士学位授予权。同年，“中国国有经济研究中心”被教育部批准成为国家人文社会科学重点研究基地。2005年，应用经济学被国务院学位委员会批准获得一级学科博士学位授予权。
