厦门大学经济研究所成立于1950年，是我国解放后高校中成立的第一个研究所，由王亚南校长亲兼第一任所长。现有政治经济学、产业经济学2个博士点（均可招收博士后），产业经济学、区域经济学2个硕士点，还有挂靠本所的福建省经济研究中心。
现任所长陈其林教授。现有在职教职工19人，其中教授6人，博士生导师5人，副教授5人，讲师5人。半个世纪以来，经济研究所一直从事马克思主义经济学、社会主义经济理论与实践的研究，积累了丰硕的学术成果，形成特色优势，在全国处于领先地位。1990年以来，承担国家级、省部级科研项目38项，获省部级以上科研成果奖20项。出版专著、教材28部，在省级以上刊物发表论文725篇。经济研究所主办的《中国经济问题》于1958年试刊，1959年由中宣部批准正式创刊，是我国解放后高校中新创办的第一家经济学专业杂志。
厦门大学经济研究所在1950年就由王亚南、傅衣凌、吴兆莘、朱保训等教授招收培养研究生。陈可焜、邓子基、谢佑权、黄良文等教授均为本所王亚南教授亲自培养的第一届研究生，也是全国最早培养的研究生。自创办以来，已培养博士、硕士100多名，在读博、硕研究生70多名
